При использовании культуры семяпочек и незрелых зародышей с целью получения отдаленных гибридов желательна предварительная цитоэмбриологическая оценка событий, происходящих при оплодотворении и на ранних стадиях эмбриогенеза (для установления времени и стадии остановки развития). Это нужно для определения сроков изолирования и для подбора условий культивирования зародыша in vitro.
Наиболее сложная задача стоит при подборе питательных сред для зародышей в недифференцированном состоянии. Кроме обычных БАВ питательные среды дополняют трофическими факторами:
- набором аминокислот,
- набором необычных сахаров,
- набором осмогиков (сорбит, маннит) и т. д.
Часто приходится вносить в среду экстракты неопределенного состава типа жидкого эндосперма кокосового ореха, каштана, кукурузы.
Культура изолированных зародышей широко используется у нас в стране:
- при гибридизации плодовых деревьев,
- в межвидовой гибридизации хлопчатника, лука, томатов,
- при межродовых скрещиваниях ячменя с рожью и пшеницей.
Иногда метод модифицируют введением промежуточного этапа получения гибридного каллуса и растений-регенерантов на его основе. Такой подход использован при получении гибридных растений табака при скрещивании N. tabacum сорт Дюбск 44 с N. occidentalis. В результате скрещивания получены гибридные семена, но проростки гибли на стадии семядолей из-за отмирания первичного корня и остановки роста. Индукция образования каллусной ткани из семядолей и гипокотилей гибридных проростков, а затем и органогенеза в каллусах позволила получить сотни амфигаплоидных растений. Затем с помощью колхицина восстановили их фертильность, и от амфидиплоидов получено второе поколение и произведены скрещивания с сортами культурного табака.
Гибридная каллусная ткань сейчас используется не только для клонирования амфигаплоидных зародышей, но и для получения вариантных форм. Так, китайскими учеными из одного исходного гибридного зародыша, полученного при скрещивании ячменя и пшеницы, создано более 100 регенератов. У половины из них выявлены различия по морфологии и окраске колоса, длине ости и другим признакам, следовательно, это - сомаклональные варианты.
Культура in vitro изолированных семяпочек и потерявших всхожесть семян - полезный метод сохранения важного селекционного материала при повреждении растений неблагоприятными погодными или биогенными условиями. Известны такие методики для риса, подсолнечника, картофеля.
Эмбриокультура может быть использована для ускорения прохождения жизненного цикла растения, что позволит сократить длительность селекционного процесса. Так, время генерации озимой пшеницы можно сократить почти на 40 дней, если 16-20-дневные изолированные зародыши прояровизировать in vitro.