С момента открытия А.Левенгуком микробов начался морфологический период в развитии микробиологии. Морфологический период занял около двухсот лет.
Морфологический период развития микробиологии связан с именем голландского ученого Антония ван Левенгука (1632-1723), который в конце XVII века с помощью изготовленного им самим микроскопа, дающего увеличение в 300 раз, открыл мир микробов. Этот ученый издал первый научный трактат по микробиологии (1695) «Тайны природы, открытые Антони ван Левенгуком». Он описывает палочковидные, шаровидные, извитые и другие формы микроорганизмов, обнаруженных в различных объектах. Открытия Левенгука вызвали интерес ученых. Однако, слабое развитие в промышленности, господствующее в науке схоластическое направление препятствовали развитию естественных наук, в том числе зарождающейся микробиологии. Долгое время наука о микробах носила лишь описательный характер – шел так называемый морфологический период ее развития.
Накопление данных о микроорганизмах привело к необходимости их систематизации. Первая научная попытка систематики микроорганизмов принадлежит датскому ученому О. Мюллеру (1785).
Первым исследователем микроорганизмов в России был врач-микробиолог М.М. Тереховский (1740-1796). В своей работе «О наливочном хаосе Линнея» он экспериментально отверг теорию о самопроизвольном зарождении жизни.
Морфологический период продолжается и до наших дней, так как наука открывает все новые и новые микробы. После открытия А. Левенгука было описано множество патогенных для человека и животных микробов.
Однако необходимо было выяснить роль микробов в природе, их жизнедеятельность, биологические свойства и этиологическую роль в возникновении болезней человека и животных. Большое значение в изучении этиологии микробов сыграли работы русского эпидемиолога Д. Самойловича, его героический опыт по самозаражению чумой. Подобные эксперименты на себе для выявления болезнетворности микробов провели затем многие ученые: М. Петтенкоффер, И.И. Мечников, Н.Ф. Гамалея, И.Г. Савченко, Д.К. Заболотный, М.С. Балоян и многие другие. Эти ученые, рискуя своей жизнью, выполнили свой долг перед человечеством. Таким образом родилась наука деонтология — наука о долге. И в наши дни многие ученые — авторы разработанных новых микробиологических, иммунобиологических, фармацевтических препаратов, руководствуясь долгом, испытывают эти препараты прежде всего на себе.